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上海交通大学特聘教授洪亮团队发布蛋白质设计大模型Venus，实现从序列到功能的精准预测，多款产品已进入产业应用，展示了在生物技术、医药研发和工业生产中的巨大潜力。

　　作为生物体的基本组成部分，蛋白质广泛存在于人们生产生活中。3月22日，上海交通大学特聘教授洪亮团队发布了蛋白质设计大模型Venus，其核心能力是让蛋白质实现功能的“定向进化”，这在国内生物技术领域引起了广泛关注。该模型设计的多款产品已进入产业应用，展示了其在生物技术、医药研发和工业生产中的巨大潜力。

　　洪亮指出，自然界中参与构成蛋白质的氨基酸有20种，一个蛋白质分子一般由几十个乃至数百个氨基酸组成，而蛋白质的功能则包含热稳定性、活性、亲和力等。Venus大模型的推出，标志着蛋白质设计进入了精准预测和功能优化的新阶段。

　　洪亮团队发布的蛋白质设计大模型Venus（受访者供图） 据介绍，与以往靠经验和高通量实验的传统方法相比，Venus大模型能完成蛋白质从序列到功能的预测，实现了从“大海捞针”到精准设计的跨越。通过提供目标蛋白质的序列信息，Venus可以快速生成一批蛋白质序列改造方案，结合实验验证，最终得到最优改造方案。

　　“数据是大模型的基础，我们建立了包含数十亿条蛋白质序列的数据集，覆盖从常规地表生物到极端环境微生物的蛋白质序列信息，其中数亿条蛋白质序列具有功能标签。”洪亮表示，这一数据集为Venus的精准设计提供了有力支撑。

　　基于海量功能未知的蛋白质数据集，Venus能够精准发掘满足苛刻应用需求的、具备超常规功能的蛋白质，有望推动这些蛋白质在生物技术、医药研发和工业生产中的广泛应用。

　　“蛋白质设计大模型的突破，不仅开辟了蛋白质从序列到功能的科学研究新方向，还打通了人工智能与生物交叉的工程化应用之路。”上海交通大学自然科学研究院院长金石表示。

　　目前，Venus设计的多款蛋白质已进入产业化阶段，例如活性高、稳定性强、产物纯的PET降解酶，以及用于超敏检测诊断的高活性碱性磷酸酶等，这些成果进一步验证了Venus大模型的实用性和有效性。

（文章来源：新华社）